Erstmals dreidimensionale Darstellungsmöglichkeit von Molekülstrukturen in zweidimensionalen elektronischen Veröffentlichungen erreicht
Publikation von Berliner Wissenschaftlern in jüngster Ausgabe der renommierten Zeitschrift „TiBS“
Nr. 262/2008 vom 08.09.2008
Eine deutsch-indische Gruppe von Wissenschaftlern um den Immungenetiker Prof. Dr. Andreas Ziegler von der Charité – Universitätsmedizin Berlin und der Freien Universität Berlin hat als erste Forschergruppe weltweit neue technische Möglichkeiten eingesetzt, um anschauliche und interaktiv zugängliche dreidimensionale Bilder komplexer Strukturen in elektronische Publikationen einzubinden. Am Beispiel eines in einer Struktur-Datenbank hinterlegten Proteins zeigten sie, wie 3D-Darstellungen von Molekülen in Dokumente eingefügt werden können, welche als „portable document format“ (PDF) vorliegen. Zum Arbeiten mit den 3D-Strukturen benötigen Leser erstmals keine zusätzlichen Programme. Diese neue, interaktive und damit vor allem auch für pädagogische Zwecke nützliche Form der Darstellung wurde in der Septemberausgabe der Zeitschrift Trends in Biochemical Sciences (TiBS) veröffentlicht. Gefördert wurde die Entwicklung durch die Volkswagen-Stiftung.
Autoren naturwissenschaftlicher Texte müssen sich seit Jahrhunderten mit zweidimensionalen Abbildungen begnügen, obwohl sie zumeist dreidimensionale Objekte beschreiben. Dies gilt für Biologen und Mediziner ebenso wie für Geographen und Astronomen. Zwar wurden in der Anatomie oder bei Globen bereits dreidimensionale Objekte zu pädagogischen Zwecken eingesetzt, doch war es bislang nicht möglich, diese auch in Texte zu integrieren. Das neue Verfahren erlaubt es den Nutzern derartiger Dokumente künftig zudem, nicht ständig „online sein“ zu müssen.
Erreicht wird die Integration dreidimensionaler Abbildungen in zweidimensionale, in elektronischer Form vorliegende Dokumente mittels der Kombination verschiedener Programme, die es ermöglichen, Objekte räumlich und interaktiv in einem PDF darzustellen. Einzige Voraussetzung für die Nutzung des von der Forschergruppe in „TiBS“ dokumentierten Darstellungsverfahrens ist es, dass der Leser das Dokument mit der integrierten Abbildung elektronisch als PDF verfügbar hat.
Literatur:
- Kumar, P., Ziegler, A., Ziegler, J., Uchanska-Ziegler, B., and Ziegler, A.: Grasping molecular structures through publication-integrated 3D models. Trends Biochem. Sci. Vol.33 No.9, 408-412 (2008)
- Tyzack, J.: “Dragging (and zooming and rotating) publication of 3D molecular structures into the 21st century”, Trends in Biochemical Sciences,Vol.33 No.9, 405-407 (“Leitartikel”)
Im Internet:
- Kumar et al., 2008: http://dx.doi.org/10.1016/j.tibs.2008.06.004
- Tyzack, 2008: http://dx.doi.org/10.1016/j.tibs.2008.07.001
- „Gebrauchsanweisung“: www.charite.de/immungenetik/model3d.html
Weitere Informationen
Weitere Informationen erteilen Ihnen gern:
- Prof. Dr. Andreas Ziegler, Telefon: 030 / 8445 1817 E-Mail: andreas.ziegler@charite.de
- Dipl.-Biol. Alexander Ziegler, Telefon: 030 / 8385 4885, E-Mail: aziegler@zoosyst-berlin.de