MrBayes
Einleitung
MrBayes ist ein Programm zur Berechnung Bayesscher Inferenz der Phylogenie.
MrBayes parallel auf Soroban starten
Um MrBayes parallel laufen zu lassen, muss die parallele Version des Programms mit mpirun
gestartet werden. Die Anzahl der Tasks, die mit --ntasks
angefordert wurde, wird als die Anzahl der parallelen Prozessen, die von mpirun
durch die Option -np
gestartet werden sollen, durch die Variable $SLURM_NTASKS
festgelegt.
#!/bin/bash #SBATCH --job-name=mrbayes_test
#SBATCH --mail-user=your.name@fu-berlin.de
#SBATCH --mail-type=end
#SBATCH --ntasks=4
#SBATCH --mem-per-cpu=1000
module add mrbayes mpirun -np $SLURM_NTASKS mb-parallel -i test.nex > test.out