Das übergeordnete Ziel des Sonderforschungsbereichs SFB 1449 „Dynamische Hydrogele auf biologischen Grenzflächen“ (www.sfb1449.de) ist es, die wichtigsten physikalisch-chemischen Parameter zu definieren, die die Schutzfunktion von Hydrogelen und Schleim an biologischen Grenzflächen im gesunden Zustand bestimmen, und Anomalien im Krankheitsfall zu definieren, um neue therapeutische Strategien zu entwickeln. Wir konzentrieren uns auf die individuellen und kombinierten Bestandteile von Hydrogelen und deren funktionelle Auswirkungen auf die Oberflächen der Atemwege und des Darms. Unser Schwerpunkt ist dabei die molekulare Definition von Schleim (Struktur, Eigenschaften und Dynamik auf molekularer Ebene), die wir auf einer sorgfältigen und umfassenden physikalischen Untersuchung stützen, die es uns ermöglicht, Hypothesen auf einer genau definierten molekularen Ebene zu überprüfen. Unsere Kenntnisse im Bereich der Modellierung werden dann auf spezifische Schlüsselfragen angewendet: Welche Rolle spielen die einzelnen Hydrogelkomponenten, d. h. Muzine, Proteine, Salz und Wasser, bei dem komplexen Prozess ihrer Netzwerkbildung und -funktion?

Aufgabengebiet:
• Mitarbeit im Projekt A03 I Netz " Probing and modeling of transport properties of hydrogels" im Rahmen des SFB 1449

• Durchführung und Auswertung von Simulationen zur Charakterisierung des Transports von Partikeln durch Hydrogele

• Simulationen zur Charakterisierung des aktiven Transports von Bakterien und enzymatisch aktiven Viren durch synthetische Hydrogele und mukusähnliche Hydrogele unter Berücksichtigung der spezifischen Wechselwirkungen mit dem Hydrogel

• Datenbasierte Parametrisierung von Gleichungen zur Modellierung der Bewegung von flagellaren Bakterien

• Berechnung der Transportdynamik mit Hilfe der nicht-Markovschen generalisierten Langevingleichung

Einstellungsvoraussetzungen:
• Abgeschlossenes wiss. Hochschulstudium (Diplom oder Master) in Physik oder einem vergleichbaren Fach.

Erwünscht:
• Erfahrungen mit der Ausführung und Auswertung von atomistischen MD Simulationen
• Kenntnisse der Statistischen Mechanik von Gleichgewichts- und Nichtgleichgewichts-Systemen

• sehr gute Studienleistungen insbesondere in numerischen Simulationsmethoden, statistischer Mechanik und Stochastik

• sehr gute mündliche und schriftliche Deutsch- und Englischkenntnisse.

Weitere Informationen erteilt Herr Prof. Dr. Roland Netz, rnetz@physik.fu-berlin.de