Unter http://www.mi.fu-berlin.de/en/inf/groups/abi/ können Sie unsere Arbeitsgruppe und Forschungsgebiete kennenlernen. Die zu besetzende Stelle wird eng mit dem Bioinformatics Solution Center (http://www.bsc.fu-berlin.de) zusammenarbeiten.

Aufgabengebiet:
Mitarbeit im EU-Projekt Waste Water Pathogens (WaWaPa). Das EU-Projekt der EUROPEAN HEALTH AND DIGITAL EXECUTIVE AGENCY (HaDEA) ist eine Kollaboration unter der Führung des Instituto de Desenvolvimento de Novas Tecnologias (UNINOVA) in Lissabon. Im Rahmen des Projekts werden regelmäßig Wasserproben an verschiedenen Standorten entnommen und anschließend metagenomisch analysiert. Dabei wird auf bekannte Pathogene geprüft. Die ausgeschriebene Stelle soll sich mit der Integration des Ganon Programms in die Analyse-Pipelines und mit Arbeiten an der Dynamisierung der HIBF-Datenstruktur beschäftigen. Die Ausschreibung erfolgt vorbehaltlich der Bereitstellung der notwendigen Mittel durch den Mittelgeber.
 
Einstellungsvoraussetzungen:
abgeschlossenes wiss. Hochschulstudium (Master) und Promotion in Bioinformatik oder vergleichbares Fachgebiet
 
(Berufs-)Erfahrung:
Die Stelle erfordert langjährige Erfahrung in der Analyse von Metagenom-Daten sowie Erfahrungen mit der Implementierung von Programmen zur Metagenomanalyse als auch mit C++ und der SeqAn Bibliothek.
 
Erwünscht:
- portugiesische Sprachkenntnisse
- Gender- und Diversitykompetenz

Weitere Informationen erteilt Herr Prof. Knut Reinert (knut.reinert@fu-berlin.de / 030/838-75222).