Unter http://www.mi.fu-berlin.de/en/inf/groups/abi/ können Sie unsere Arbeitsgruppe und Forschungsgebiete kennenlernen.

Aufgabengebiet:
Mitarbeit im DFG-Projekt RegExBis. Das Projekt ist eine Kollaboration mit der HU Berlin und dem Technion Haifa. Die Stelle wird sich mit der Entwicklung k-mer basierter Filter für die effiziente Datenbanksuche von Instanzen regulärer Ausdrücke und sinnvoller Erweiterungen (z.B. Distanzbeschränkungen) derselben beschäftigen. Kern wird die Anfrage von bioinformatischen Ausdrücken sein (d.h. für das Filtern in Genom- und Proteindatenbanken).

Einstellungsvoraussetzungen:
• Abgeschlossenes wiss. Hochschulstudium (Master) in Bioinformatik, Informatik oder vergleichbar

Erwünscht:

• Wenn möglich, bereits Vorbeschäftigungen ähnlicher Art.
• Forschungserfahrung in k-mer basierter Sequenzanalyse
• Erfahrung mit Programmierung in der SeqAn Bibliothek
• sichere Kenntnisse in C++ und generischer Programmierung
• Kenntnisse in Parallelprogrammierung und Vektorisierung
• Erfahrung im Erstellen einer Software-Dokumentation
• Vertrautheit mit Next Generation Sequencing (NGS) Problemen und Daten

Weitere Informationen erteilt Herr Prof. Dr. Knut Reinert (knut.reinert@fu-berlin.de / 030/838-75222).