Der Ursprung der Wuhan University liegt im „Ziqiang Institut“, welches 1893 von Zhang Zhidong gegründet wurde. Im Laufe der Geschichte wurde dieses Institut mehrmals unbenannt, bis 1949 definitiv der Name Wuhan University festgelegt wurde. Im Jahr 2000 haben sich die „Wuhan University of Hydraulic and Electric Engineering“, die „Wuhan Technical University of Surveying and Mapping“ und die „Hubei Medical University“ zur Wuhan University zusammengeschlossen.

Heute gehört die Wuhan University zu den 211-Projekt- und 985-Projekthochschulen und belegte 2013 den 16. Platz im Netbig Chinese University Ranking 2013. Sie bietet 114 Bachelor-, 317 Master-, 284 PhD- und 32 Postdoc-Programme an und hat ihre Stärken in den Bereichen Physik, Biowissenschaft, Umwelttechnik, Hydrologie, Informatik, Jura, Soziologie und Philosophie.

Der Campus der Wuhan University, einer der vier schönsten in China, liegt pittoresk am Fuß des Luojia Berges und am berühmten Ostsee, einem der größten Binnenseen Chinas. Besonders faszinierend und schön ist dieser in Grün versunkene Campus während der Kirschblütenzeit im März, die jedes Jahr einen großen Besucheransturm auslöst. Doch neben dem grünen Campus sind es auch die Gebäude im traditionellen chinesischen Stil, die den Campus der Wuhan University landesweit berühmt machen.

Seit 2009 ist die Wuhan University die Partnerhochschule der Freien Universität Berlin.