Die Freie Universität Berlin wurde erstmals 2007 in der Exzellenzinitiative als eine von damals bundesweit neun Exzellenzuniversitäten ausgezeichnet und hat diesen Titel im Juni 2012 mit ihrem Zukunftskonzept „Veritas - Iustitia - Libertas. Internationale Netzwerkuniversität“ verteidigt (Förderlinie 3) mit dem Ergebnis der Exzellenzförderung bis 2019. Grundlage für den Antrag waren die drei Leitbegriffe der Freien Universität sowie ihre intensive Vernetzung in Forschung und Lehre auf regionaler, nationaler wie internationaler Ebene, die für die 1948 auf der „Insel“ West-Berlin gegründete Universität von Anfang an unerlässlich war. Das Zukunftskonzept schloss an bereits in den 1990er-Jahren begonnene Profilbildungsprozesse an und legte die Grundlage für das jetzige Selbstverständnis der Freien Universität und ihr eigenständiges Profil in der Berlin University Alliance.