La Freie Universität Berlin mantiene convenios con las siguientes universidades en la región:

Argentina

• Universidad Nacional de Córdoba (UNC)

Brasil

• Universidade de São Paulo (USP)

• Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)

• Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro (PUC-Rio)

• Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)

Chile

• Pontificia Universidad Católica de Chile (UC)

Colombia

• Pontificia Universidad Javeriana (PUJ)
• Universidad de los Andes (Uniandes)
• Universidad Nacional de Colombia (UNAL)

México

• El Colegio de México (COLMEX)
• Universidad de Guadalajara (UdeG)
• Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM)

Perú

• Pontificia Universidad Católica del Perú (PUCP)

El Instituto de Estudios Latinoamericanos (LAI) de la Freie Universität Berlin mantiene adicionales convenios de cooperación en áreas y/o en proyectos específicos. Estos pueden ser consultados aquí.