Nachfolgende Veranstaltungen S, P insgesamt 7,5 SWS/7,5 cr. (für Studierende der Biochemie) |
|
21 609a
- S - |
Seminar zum Praktikum 21609b
(für Biochemiker, Biologen, Vetmed., Med. mit vorher erfolgreich absolviertem Praktikum der Molekularbiologie oder Mikrobiologie, ab 7. Sem.)
(max. 6 Teiln.); siehe Praktikum 21609 b
Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR), Abt. Biologische Sicherheit, Diedersdorfer Weg 1, 12277 Berlin (Marienfelde) |
(s. A.) |
Bernd Appel,
Eckhard Strauch,
Stefan Hertwig,
Lothar Beutin,
Thomas Alter |
| Prof. B. Appel: Bernd.Appel@bfr.bund.de |
| |
21 609b
- P - |
Mikrobiologische, biochemische, immunologische Methoden und Verfahren zur Erregercharakterisierung, einschließlich Lebensmittelhygiene und mikrobiologische Risikobewertung
(für Biochemiker, Biologen, Vetmed., Med. mit vorher erfolgreich absolviertem Praktikum der Molekularbiologie oder Mikrobiologie, ab 7. Sem.)
(max. 6 Teiln.); 4-wöchige Blockveranstaltung; Vergabe: 14.04., 9.00, Hs, Thielallee 63;
Bundesinstitut für Risikobewertung (BfR), Abt. Biologische Sicherheit, Diedersdorfer Weg 1, 12277 Berlin (Marienfelde) |
(14.4.) |
Bernd Appel,
Eckhard Strauch,
Stefan Hertwig,
Lothar Beutin,
Thomas Alter |
| Prof. B. Appel: Bernd.Appel@bfr.bund.de |
| |
Nachfolgende Veranstaltungen V, P insgesamt 5 SWS/5 cr. |
|
| Veranstaltung entfällt! |
| Raumänderung |
21 611a
- V - |
Vorlesung zum Praktikum 21611b
; s. A. - Biochemie, Thielallee 63, Raum 225/227 |
(s. A.) |
Werner Schröder |
Kommentar.: Inhalt / contents
purification of proteins by 1 and 2D electrophoresis, RP and IE high
performance
liquid chromatographie, electroblotting of proteins onto PVDF membrane,
manual and automatic N-terminal sequencing of proteins and peptides (ABI
473A Proteinsequencer), peptide generation by enzymatic and chemical cleavage
methods ( in solution, onto PVDF membrane and in gel)
modification and identification of cysteine and phosphoserine residues in
proteins
amino acid analysis, database search concerning protein identification and
homology
automatic synthesis of DNA and RNA oligomers, purification by HPLC and gel-
electrophoresis,
theoretical: mass spectrometry in protein and nucleic acid analysis
lectures: advanced methods in protein sequence analysis
Dr. W. Schröder: wfkjschr@chemie.fu-berlin.de |
| |
| Veranstaltung entfällt! |
| Raumänderung |
21 611b
- P - |
Proteinanalytisches Praktikum (Mikrosequenzierung)
; Block - Biochemie, Thielallee 63, Raum 225/227
Vergabe: 14.04., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(14.4.) |
Werner Schröder |
Kommentar.: Inhalt / contents
purification of proteins by 1 and 2D electrophoresis, RP and IE high
performance
liquid chromatographie, electroblotting of proteins onto PVDF membrane,
manual and automatic N-terminal sequencing of proteins and peptides (ABI
473A Proteinsequencer), peptide generation by enzymatic and chemical cleavage
methods ( in solution, onto PVDF membrane and in gel)
modification and identification of cysteine and phosphoserine residues in
proteins
amino acid analysis, database search concerning protein identification and
homology
automatic synthesis of DNA and RNA oligomers, purification by HPLC and gel-
electrophoresis,
theoretical: mass spectrometry in protein and nucleic acid analysis
lectures: advanced methods in protein sequence analysis
Dr. W. Schröder: wfkjschr@chemie.fu-berlin.de |
| |
21 612a
- V - |
Von der Suche nach vasoaktiven Hormonen zum Blutdruck senkenden Therapeutikum
(Vorlesung für Naturwissenschaftler und Mediziner)
(2 SWS) (3 cr); wöchentlich
Institut für Toxikologie Garystr. 5, Seminarraum
Vorb.: 15.04., 14.00 |
(15.4.) |
Joachim Jankowski,
Vera Jankowski |
1. Inhalt (contents):
Patho-/ Biochemie des Blutdrucksystems, Isolierung, Nachweis und Identifizierung von biologisch aktiven Molekülen
Pharmakologie von vasoaktiven Hormonen
2. Literatur (literature)
1. Jankowski V, et al., Nature Medicine 11:223-227, 2005
2. Jankowski V, et al., Hypertension 46:591-597, 2005
3. Jankowski J, et al. Arterioscler Thromb Vasc Biol 23:1231-1238, 2003
Prof. Dr. J. Jankowski: JOACHIM.JANKOWSKI@CHARITE.DE
Dr. V. Jankowski: Vera.Jankowski@charite.de |
| |
Nachfolgende Veranstaltungen S, P insgesamt 5 SWS/5 cr. |
|
21 612b
- S - |
Seminar zum Praktikum 21612c
; n. V. - Institut für Toxikologie Garystr. 5, Seminarraum
Vorb.: 15.04., 14.00 |
(15.4.) |
Joachim Jankowski,
Vera Jankowski |
1. Inhalt (contents) :
Nachweis biologisch aktiver Biomoleküle
Massenspektrometrie von Biomolekülen
2. Literatur (literature):
siehe 21 612 a
Voraussetzung: Besuch der Vorlesung : "Von der Suche nach vasoaktiven Hormonen zum blutdrucksenkenden Therapeutikum"
4. Beginn (beginning): nach Absprache
Prof. Dr. J. Jankowski: JOACHIM.JANKOWSKI@CHARITE.DE
Dr. V. Jankowski: Vera.Jankowski@charite.de |
| |
21 612c
- P - |
Nachweis und Identifizierung von biologisch aktiven Biomolekülen
(für Naturwissenschaftler und Mediziner - Voraussetzung: Besuch der Vorlesung 21612a)
; Vergabe 14.4., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs
Institut für Toxikologie Garystr. 5, Seminarraum
Vorb.: 15.4., 14.00, Garystr. 5 |
(14.4.) |
Joachim Jankowski,
Vera Jankowski |
1. Inhalt (contents) :
Nachweis biologisch aktiver Biomoleküle
Massenspektrometrie von Biomolekülen
2. Literatur (literature):
siehe 21 612a
Voraussetzung: Besuch der Vorlesung : "Von der Suche nach vasoaktiven Hormonen zum blutdrucksenkenden Therapeutikum"
4. Beginn (beginning): nach Absprache
Prof. Dr. J. Jankowski: JOACHIM.JANKOWSKI@CHARITE.DE
Dr. V. Jankowski: Vera.Jankowski@charite.de |
| |
21 613a
- V - |
Protein Engineering
; einmalig 12.6. ganztägig - FMP, Robert-Rössle-Str. 10, Berlin-Buch, Raum C308 |
(12.6.) |
Christian Freund |
Theorie: Rationales Design, Protein Bibliotheken, Display-Verfahren, NMR-Spektroskopie, Yeast-two-hybrid.
Praktisch: Protein-Expression in E. coli, Hefe-Transformation, NMR-Epitop-Mapping, Phage Display.
PD Dr. C. Freund: freund@fmp-berlin.de |
| |
Nachfolgende Veranstaltungen S, P (1 Wo) insgesamt 2,5 SWS/2,5 cr. |
|
21 613b
- S - |
Seminar zum Praktikum Protein Engineering
(Voraussetzung für die Teilnahme ist der Besuch der Vorlesung 21613a)
; Termin s. P
FMP, Robert-Rössle-Str. 10, Berlin-Buch, Raum C308
Vergabe: 14.04., 9.00, Hs, Biochemie, Thielallee 63 (P/S) |
(14.4.) |
Christian Freund |
Theorie: Rationales Design, Protein Bibliotheken, Display-Verfahren, NMR-Spektroskopie, Yeast-two-hybrid.
Praktisch: Protein-Expression in E. coli, Hefe-Transformation, NMR-Epitop-Mapping, Phage Display.
PD Dr. C. Freund: freund@fmp-berlin.de |
| |
21 613c
- P - |
Praktikum Protein Engineering
(Voraussetzung für die Teilnahme ist der Besuch der Vorlesung 21613a)
; 16.6.-20.6. ganztägig - FMP, Robert-Rössle-Str. 10, Berlin-Buch, Raum C308
Vergabe: 14.04., 9.00, Hs, Biochemie, Thielallee 63 |
(14.4.) |
Christian Freund |
Theorie: Rationales Design, Protein Bibliotheken, Display-Verfahren, NMR-Spektroskopie, Yeast-two-hybrid.
Praktisch: Protein-Expression in E. coli, Hefe-Transformation, NMR-Epitop-Mapping, Phage Display.
PD Dr. C. Freund: freund@fmp-berlin.de |
| |
| Veranstaltung entfällt! |
21 614a
- V - |
Proteinfehlfaltung als molekulares Schlüsselereignis bei neurodegenerativen Demenzen wie Alzheimer- und Creutzfeldt-Jakob-Krankheit
(2 SWS) (3 cr); Der Besuch der Vorlesung ist Voraussetzung für die Teilnahme am Seminar/Praktikum 21614b,c (im WS). Mi 17.00-18.30 - Biochemie Thielallee 63, Seminarraum |
(16.4.) |
Michael Beekes |
Nach einem Überblick über die molekularen Abläufe und pathophysiologischen Prozesse bei
neurodegenerativen Demenzen sollen Gemeinsamkeiten und Unterschiede in der Pathogenese der
Alzheimer-, Lewy-Körperchen- und Creutzfeldt-Jakob-Krankheit beleuchtet werden um das
proteinbiochemische Leitmotiv dieser Erkrankungen zu verdeutlichen - die Fehlfaltung und
Aggregation spezieller wirtseigener Eiweiße. Dabei werden grundlegende Prinzipien der Faltung
und intermolekularen Assoziation von Proteinen erläutert, Techniken zur Untersuchung der
dreidimensionalen Eiweißstruktur vorgestellt sowie unterschiedliche experimentelle Ansätze zur
Erforschung dementieller Amyloidosen aufgezeigt. Dies soll es ermöglichen, nachzuvollziehen,
wie sich aus einem molekularen Verständnis des Krankheitsgeschehens neue Ansätze für die
Behandlung neurodegenerativer Demenzen ergeben. Zum Abschluß ist in einem Exkurs zum Thema BSE
und Creutzfeldt-Jakob-Krankheit vorgesehen, das Prionen-Konzept der "infektiösen
Proteinkonformationen" kritisch zu diskutieren.
Teilnehmerkreis: Die Vorlesung richtet sich fachübergreifend an Biowissenschaftler und
Mediziner im Hauptstudium.
Dr. M. Beekes: BeekesM@rki.de |
| |
| Vorbesprechung im SR |
21 616
- V - |
Moderne Methoden der Bioanalytik
(2 SWS) (3 cr); Der Besuch der V ist Voraussetzung für das S/P 21618 im WiSe 08/09 (V muss immer in einem vorangegangenen Semester besucht werden.) Mo 18.00-19.30 - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal
Vorbesprechung am Di.,15.04., 18.00, Biochemie, Thielallee 63, Seminarraum |
(15.4.) |
Hartmut Schlüter,
Maria Trusch |
| |
21 617
- V - |
Analyse von Nukleinsäuren und anderen kleinen Molekülen
(Die Teilnahme an der Vorlesung ist Voraussetzung für eine studentische Mitarbeit.)
(1 SWS) (1,5 cr); Block - MPI für Molekulare Genetik, Ihnestr. 73, 0.102
Voranmeldung unter: sauer@molgen.mpg.de |
(n. V.) |
Sascha Sauer |
| |
Nachfolgende Veranstaltungen S, P insgesamt 5 SWS/5 cr. |
|
| Vorbesprechung im SR |
21 618a
- S - |
Seminar zum Praktikum 21 618b
(Voraussetzung: Besuch der Vorlesung 21 616 in einem vorangegangenen Semester.)
; s. A. - Charité, Tucholskystr. 2, Raum 01-022, 10117 Berlin;
Vorb.: 15.04.,18.00, Biochemie, SR, Thielallee 63 |
(15.4.) |
Hartmut Schlüter,
Maria Trusch |
Inhalt (21 618a + b):
Patho-/-Biochemie regulatorischer Proteasen
Nachweis von Enzymaktivitäten mit der Massenspektrometrie;
Charakterisierung von Proteasen;
Chromatographische Reinigung von Proteinen;
Identifizierung von Peptiden und Proteinen mit der Massenspektrometrie
Literatur (21 618a + b):
Schlüter, H., Jankowski, J., Rykl, J., Thiemann, J., Belgardt, S.,
Zidek, W., Wittmann, B., and Pohl, T. (2003). Detection of protease
activities with the mass-spectrometry-assisted enzyme-screening (MES)
system. Anal Bioanal Chem 377, 1102-7.
Schlüter, H., Jankowski, J.,Thiemann, J., Rykl, J., Kurzawski, S.,
Runge, D. Determination of enzyme activities by mass spectrometry ?
benefits and limitations (2004). In "Experimental Standard Conditions of
Enzyme Characterizations" M.G. Hicks &C. Kettner (Eds.), Proceedings of
the 1st Int?l Beilstein Symposium on ESCEC. Logos Verlag Berlin.
Thiemann, T., Jankowski, J., Rykl, J., Kurzawski, S., Pohl, T.,
Wittmann-Liebold, B., and Schlüter, H. (2004). Principle and
applications of the protein-purification-parameter screening system.
Journal of Chromatography A 1043, 73?80.
Wu Q, Kuo HC, Deng GG.(2005). Serine proteases and cardiac function.
Biochim Biophys Acta. 1751,:82-94.
Aktuelle Lit. Siehe Medline: Suchbegriffe:
proteases AND hormones AND review
proteases AND regulatory AND review
proteome OR proteomics AND review
chromatography AND protein AND purification AND review
protein AND identification AND mass spectrometry AND review
Prof. Dr. H. Schlüter: Hartmut.Schlueter@charite.de |
| |
| Vorbesprechung im SR |
21 618b
- P - |
Reinigung, Charakterisierung und Identifizierung regulatorischer Proteasen
(Voraussetzung: Besuch der Vorlesung 21 616 in einem vorangegangenen Semester.)
; Charité, Tucholskystr. 2, Raum 01-022, 10117 Berlin;
Vergabe: 14.04., 9.00 und Vorb.: 15.04.,18.00 in der Biochemie,SR, Thielallee 63 |
(14.4.) |
Hartmut Schlüter,
Maria Trusch |
Inhalt (21 618a + b):
Patho-/-Biochemie regulatorischer Proteasen
Nachweis von Enzymaktivitäten mit der Massenspektrometrie;
Charakterisierung von Proteasen;
Chromatographische Reinigung von Proteinen;
Identifizierung von Peptiden und Proteinen mit der Massenspektrometrie
Literatur (21 618a + b):
Schlüter, H., Jankowski, J., Rykl, J., Thiemann, J., Belgardt, S.,
Zidek, W., Wittmann, B., and Pohl, T. (2003). Detection of protease
activities with the mass-spectrometry-assisted enzyme-screening (MES)
system. Anal Bioanal Chem 377, 1102-7.
Schlüter, H., Jankowski, J.,Thiemann, J., Rykl, J., Kurzawski, S.,
Runge, D. Determination of enzyme activities by mass spectrometry ?
benefits and limitations (2004). In "Experimental Standard Conditions of
Enzyme Characterizations" M.G. Hicks &C. Kettner (Eds.), Proceedings of
the 1st Int?l Beilstein Symposium on ESCEC. Logos Verlag Berlin.
Thiemann, T., Jankowski, J., Rykl, J., Kurzawski, S., Pohl, T.,
Wittmann-Liebold, B., and Schlüter, H. (2004). Principle and
applications of the protein-purification-parameter screening system.
Journal of Chromatography A 1043, 73?80.
Wu Q, Kuo HC, Deng GG.(2005). Serine proteases and cardiac function.
Biochim Biophys Acta. 1751,:82-94.
Aktuelle Lit. Siehe Medline: Suchbegriffe:
proteases AND hormones AND review
proteases AND regulatory AND review
proteome OR proteomics AND review
chromatography AND protein AND purification AND review
protein AND identification AND mass spectrometry AND review
Prof. Dr. H. Schlüter: Hartmut.Schlueter@charite.de |
| |
21 620a
- V - |
Vorlesung zum Praktikum RNA-Technologien, Nukleinsäuresynthese, Ribozyme, in vitro-Selektion
(1,5 SWS) (3 cr); Termin siehe Praktikum
Biochemie Thielallee 63, Seminarraum |
(s. A.) |
Volker Erdmann,
Jens Peter Fürste,
Werner Schröder |
Inhalt:
Chemische Synthese von Nukleinsäuren, Ribozymstrategien, Untersuchungen modifizierter Oligonukleotide, in vitro-Selektion von Aptameren.
Prof. Dr. V. A. Erdmann: erdmann@chemie.fu-berlin.de
Dr. J. P. Fürste: fuerste@chemie.fu-berlin.de
Dr. W. Schröder: wfkjschr@chemie.fu-berlin.de |
| |
21 620b
- S - |
Seminar zum Praktikum RNA-Technologien, Nukleinsäuresynthese, Ribozyme, in vitro-Selektion
(1 SWS) (1 cr); Termin siehe Praktikum
Biochemie Thielallee 63, Seminarraum |
(s. A.) |
Volker Erdmann,
Jens Peter Fürste,
Werner Schröder |
Inhalt:
Referate zur den RNA-Technologien
Prof. Dr. V. A. Erdmann: erdmann@chemie.fu-berlin.de
Dr. J. P. Fürste: fuerste@chemie.fu-berlin.de
Dr. W. Schröder: wfkjschr@chemie.fu-berlin.de |
| |
21 620c
- P - |
RNA-Technologien, Teil I, Nukleinsäuresynthese, Ribozyme, in vitro-Selektion
(5 SWS) (5 cr); ganztägig 7.7.-18.7. - Biochemie Thielallee 63, 007 (F-Praktikum)
Vergabe: 14.04., 9.00 Uhr, Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(s. A.) |
Volker Erdmann,
Jens Peter Fürste,
Werner Schröder |
Inhalt:
Chemische Synthese und Reinigung von Oligonukleotiden, Spaltungskinetik an Hammerhead-Ribozymen, Untersuchungen modifizierter Oligonukleotide, in vitro-Selektion von Aptameren.
Prof. Dr. V. A. Erdmann: erdmann@chemie.fu-berlin.de
Dr. J. P. Fürste: fuerste@chemie.fu-berlin.de
Dr. W. Schröder: wfkjschr@chemie.fu-berlin.de |
| |
| Veranstaltung entfällt! |
21 623
- P - |
Zellbiologie: Einfluss der extrazellulären Domänen des Li-Cadherins auf die Zelladhäsion
(5 SWS) (5 cr); Vergabe: 14.04., 9.00, Biochemie, Thielallee 63, Hs 19.5.-30.5. 9.00-17.00 - Zentralinstitut für Laboratoriumsmedizin und Pathobiochemie, Charité - Campus UKBF, Hindenburgdamm 30, 12205 Berlin, 5. OG, Fahrstuhl 15, Raum 5506 |
(14.4.) |
Jürgen Helmers |
Inhalt:
Das Praktikum beschäftigt sich mit dem Einfluss der extrazellulären Domänen des LI-Cadherins auf die Zelladhäsion. Das Praktikum beinhaltet die Expression und Reinigung rekombinanter Proteine, die genetische Modifikation von eukaryontischen Zellen sowie die Durchführung eines Zelladhäsionsassays.
email: juergen.helmers@charite.de |
| |
21 624a
- V - |
Molecular Cell Biology
(1 SWS) (1,5 cr) (Englisch); Di 19.00-19.45 - Charité-Campus Virchow-Klinikum, Forschungshaus, SR 1.0020
Vorb.: 14.04., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(22.4.) |
Reinhard Geßner,
Jens Peter von Kries
u. Mitarb. |
1. Contents:
This weekly lecture gives a brief survey of all major fields of molecular cell biology as well as an in depth view on cell adhesion, signal transduction and cellular oncogenesis. It also features several modern techniques commonly used in cell biology.
2. Literature:
Books: "Molecular Biology of the Cell" by Alberts et al. (4th, 2002, Garland Pub, ISBN 081534072-9, 5th edition, ISBN 081534105-9, will be published on 31.12.2007), "Molecular Cell Biology" by Loish et al. (6th, Aug 2007, Palgrave Macmillan, ISBN 142920314-5) and recent journal articles distributed and presented in the accompanying seminar (21 624b).
3. Further remarks:
The participants are advised to read prior to every lecture the respective chapter(s) in one of the recommended text books. In addition, everybody is required to present a related paper in the accompanying seminar.
Priv.-Doz. Dr. R. Geßner: gessner@charite.de
Dr. J. P. v. Kries: kries@fmp-berlin.de |
| |
21 624b
- S - |
Molecular Cell Biology
(1 SWS) (1 cr) (Englisch); Di 19.45-20.30 - Charité-Campus Virchow-Klinikum, Forschungshaus, SR 1.0020
Vorb.: 14.04., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(22.4.) |
Reinhard Geßner,
Jens Peter von Kries
u. Mitarb. |
1. Contents:
This weekly seminar accompanies the lecture "Molecular Cell Biology" (21 624a). Every participant is required to present a current journal article related to the subject of the lecture of the same day. The presentation and the subsequent discussion will be in English. The participants are encouraged to use the provided video beamer for their presentations.
2. Literature:
Books: "Molecular Biology of the Cell" by Alberts et al. (4th, 2002, Garland Pub, ISBN 081534072-9, 5th edition, ISBN 081534105-9, will be published on 31.12.2007), "Molecular Cell Biology" by Loish et al. (6th, Aug 2007, Palgrave Macmillan, ISBN 142920314-5) and recent journal articles distributed and presented in this seminar.
3. Further remarks:
At the end of the term a multiple choice test will be given to the participants. Only those that present a paper and pass the test will be admitted to the practical course.
Priv.-Doz. Dr. R. Geßner: gessner@charite.de
Dr. J. P. v. Kries: kries@fmp-berlin.de |
| |
21 624c
- P - |
Praktikum "Molecular Cell Biology"
(Voraussetzung ist die Teilnahme an der Vorlesung und dem Seminar "Molecular Cell Biology" (21 624a,b))
(5 SWS) (5 cr) (Englisch); Termin nach Absprach, 2 Wo. ganztägig - Charité-Campus Mitte, Charité-Campus Virchow-Klinikum und Max-Delbrück-Center für Molekulare Medizin;
Vorb.: 14.04., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(14.4.) |
Michael Baier,
Reinhard Geßner,
Jens Peter von Kries,
Klaus-Peter Knobeloch,
Achim Kramer,
Ulrike Ziebold
u. Mitarbeiter |
1. Contents:
This practical course concentrates on cell adhesion, cellular oncogenesis and molecular clocks. It leads the participants from simple cell culture techniques to genetic modifications of cellular systems and ultimately to tracing molecular events within living cells with state of the art techniques.
2. Literature:
Books: "Molecular Biology of the Cell" by Alberts et al. (4th, 2002, Garland Pub, ISBN 081534072-9, 5th edition, ISBN 081534105-9, will be published on 31.12.2007), "Molecular Cell Biology" by Loish et al. (6th, Aug 2007, Palgrave Macmillan, ISBN 142920314-5) and recent journal articles reviewed in the accompanying seminar (21 624b).
3. Further remarks:
Required for admission is the successfull participation in
the accompanying lecture and seminar "Molecular Cell Biology" (21 624a/b). Each
participant is required to prepare at the end of the practical course a written protocol in German or English
language.
4. Beginning:
Usually on Monday 9:00 am of the second last week of the lecture
free period following the current term.
Priv.-Doz. Dr. R. Geßner: gessner@charite.de
Dr. J. P. v. Kries: kries@fmp-berlin.de |
| |
| Neu |
21 626
- V - |
Membranproteine: Klassifizierung, Struktur und Funktion
(2 SWS) (3 cr); Di 18.00-20.00 - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(15.4.) |
Stefan Kubick |
Inhalt:
Typen von integralen und peripheren Membranproteinen: Rezeptoren, Ionenkanäle, Transportproteine, Enzyme und Adhäsionsmoleküle. Interaktion mit intra- und extrazellulären Elementen, Stofftransport, Ligandinteraktion und Signaltransduktion.
Gliederung der Vorlesung: (SS 2008; 14.4.2008 – 19.7.2008; 2 SWS)
I. Membranen und Membranproteinsynthese (4 Vorlesungsstunden)
1. Molekulare Struktur von Membranen
• Plasmamembran der eukaryontischen Zelle, „fluid mosaic modell“
• Zusammensetzung der Erythrocytenmembran
• Synthetische Bilayer
• „large/giant unilamellar vesicles“
2. Membransynthese, Differenzierung und Recycling
• Lipidsynthese im ER, Golgi und Mitochondrien
• Synthese sekretorischer Proteine, ER- und Golgi-Funktion
• Protein-Prozessierung, Glykosylierung (posttranslationale
Modifikation)
3. Lipid rafts
• Lipidkomponenten in zellulären Membranen
• Membransubdomänen und Caveolae
• „detergent-resistant membranes“, Lipidkomposition in
Mikrodomänen
• Visualisierung von „raft-like domains“ in Modell Membranen
• „raft“ assoziierte Membranproteine
4. Vektorielle Organisation der Zelle, Stofftransport bei Metabolismus
und Sekretion, Proteinsynthese
• Synthese integraler Membranproteine, single-pass / multi-pass
(Typ I-VI)
• Signalpeptide, Protein-Sorting
• „Vesicle-Flow“ ER – Plasmamembran
• Synthese membranassoziierter Proteine, Lipidmodifikationen
II. Rezeptortypen und allgemeine Signaltransduktion
(8 Vorlesungsstunden)
1. Rezeptoren der Plasmamembran („cell surface receptors“)
• Katalytisch aktive Rezeptoren
• G-Protein gekoppelte Rezeptoren
• Rezeptoren ohne katalytische Aktivität oder G-Protein-Kopplung
2. Signaltransduktionsmechanismen
• G-Proteine
• Ras Proteine, kleine GTP bindende Proteine
• Adenylatzyklase und Phosphodiesterasen (Signal-Amplifikation)
• Phospholipase A2, Phospholipase C, Phospholipase D
• „second messenger systeme“ cAMP / IP3
• intrazelluläre Signaltransduktionskaskaden (Crosstalk)
III. Multigenfamilien von Membranproteinen: Odorant-Rezeptoren
(4 Vorlesungsstunden)
• Identifizierung von Odorant-Rezeptoren (Methode:
PCR-Amplifikation einer Multigenfamilie, RFLP-Analyse,
Hydrophobizitätsplots)
• Lokalisation olfaktorischer Rezeptoren, Topologie des
olfaktorischen Epithels (Methode: in situ Hybridisierung,
genspezifische RNA-Sonden)
• Funktionelle Charakterisierung von Odorant-Rezeptoren,
Heterologe Expression, Ligandscreening-Methoden
• Signaltransduktion im olfaktorischen Epithel
• Neuronale Projektion, chemotopisches Pattern des
olfaktorischen Epithels
IV. Spezielle G-Protein gekoppelte Rezeptoren (Struktur,
Signaltransduktion, Agonisten/Antagonisten)
(4 Vorlesungsstunden)
1. „non-peptide receptors“
• Acetylcholinrezeptoren (mACh)
• Adrenerge Rezeptoren (alpha, beta)
• Canabinoid-Rezeptoren
• Dopamin-Rezeptoren (G-Protein gekoppelt)
• Histamin-Rezeptoren
• Serotonin-Rezeptoren
2. „peptide receptors“
• Angiotensin-Rezeptoren (Renin-Angiotensin-System)
• Bradykinin-Rezeptoren
• Chemokin-Rezeptoren
• Cytokin-Rezeptoren (HIV, virale Adhäsion)
• Opioid-Rezeptoren
• Vasopressin- und Oxytocin-Rezeptoren
V. Ionenkanäle (4 Vorlesungsstunden)
• Calcium Kanäle (Herz-Kreislauf-System, Calciumantagonisten)
• Chlorid Kanäle (CFTR, Mukoviszidose)
• Kalium Kanäle (Mechanisch aktiviert, tip links der Stereozilien)
• Natrium Kanäle (Spannungsaktiviert / epitheliale Natriumkanäle)
• TRP Kanäle (TRPV Unterfamilie, Vanilloid Rezeptoren)
VI. Arbeitsmethoden (4 Vorlesungsstunden)
1. Methoden zur Herstellung von Membranproteinen
• Bakterielle Expressionssysteme
• Proteinexpression in Hefe
• Eukaryontische Expressionssysteme
• Zellfreie pro- und eukaryontische Synthesesysteme (in vitro
Translation)
• Membranprotein-Reinigungstechnologien
2. Methoden zur Analyse von Struktur und Funktion
membranständiger Proteine
• Fluoreszenzmikroskopische Analysen
• Charakterisierung von Membranproteinkomplexen (FRET)
• In vitro Rekonstitution von Membranproteinen
• Transportvorgänge an Membranen (peptid nanopores, fluid flow,
scanning electrochemical microscopie)
• Elektrophysiologische Charakterisierung (Patch Clamp)
• Atomkraftmikroskopie
Lernziele: Den Studierenden werden in dieser Vorlesung Kenntnisse der Topologie und Funktion der wichtigsten Klassen von Membranproteinen vermittelt. Es werden Strukturen, biochemische Eigenschaften, Regulation und physiologische Bedeutung verschiedener Membranproteine erläutert. Signaltransduktionskaskaden, Rezeptor-Ligand Interaktionen und pharmakologische Eigenschaften dieser Membranproteine werden dargestellt. Lipid-Membranproteinwechselwirkungen und posttranslationale Modifikationen werden an ausgewählten Beispielen membranadhärenter und transmembranärer Proteine behandelt. Die aufgezeigten analytischen Methoden zur Darstellung und Charakterisierung von Membranproteinen erweitern das Spektrum biochemischer Arbeitsmethoden.
Literatur:
• Stryer: Biochemie (6. Auflage)
• Alberts: Molekularbiologie der Zelle (4. Auflage)
• Forth, Henschler: Pharmakologie und Toxikologie
• Offermanns, Rosenthal: Encyclopedic Reference of Molecular
Pharmacology
• Boron: Medical Physiology, A Cellular and Molecular Approach
• Fielding: Lipid Rafts and Caveolae
• Krauss: Biochemistry of Signal Transduction and Regulation
• Aktuelle Publikationen
Dr. S. Kubick: kubick@rna-network.com |
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21 627a
- S - |
Membrane Traffic and Signaling
(Voraussetzung für Besuch LV 21 627b,c im WS 2008/09)
(2 SWS) (2 cr) (Englisch); Mi 18.00-19.30 - Takustr. 6, 003 (Seminarraum EG)
Vorb.: 16.04., 18:00 Uhr |
(16.4.) |
Volker Haucke,
Michael Krauss,
Marnix Wieffer,
Julia Mößinger,
Kira Gromova |
| Prof. V. Haucke: vhaucke@chemie.fu-berlin.de |
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Nachfolgende Veranstaltungen V, P insgesamt 5 SWS/5 cr. |
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21 627b
- V - |
Membrane Traffic and Signaling
(Englisch); 2 Wo. s. A. - Takustr. 6, 003 (Seminarraum EG)
Begleitend zur LV 21627c. |
(s. A.) |
Volker Haucke,
Claudia Miech |
| Prof. V. Haucke: vhaucke@chemie.fu-berlin.de |
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21 627c
- P - |
Membrane Traffic and Signaling
(Voraussetzung: Besuch der LV 21 627a in einem vorangegangenen Semester)
(Englisch); 31.3.-11.4. ganztägig - Takustr. 6, 003 (Seminarraum EG) |
(31.3.) |
Volker Haucke,
Michael Krauss,
Marnix Wieffer,
Julia Mößinger,
Kira Gromova |
| Prof. V. Haucke: vhaucke@chemie.fu-berlin.de |
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21 628
- S - |
Current problems in cellular membrane biochemistry
(für Fortgeschrittene, Diplomand/inn/en, Doktorand/inn/en (Biochemie))
(2 SWS) (4 cr) (Englisch); ganzjährig Fr 10.00-12.00 - Takustr. 6, 121 (Seminarraum AG Haucke) |
(s. A.) |
Volker Haucke,
Michael Krauss,
Claudia Miech |
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21 630a
- S - |
Zellbiologisches Seminar für Naturwissenschaftler und Mediziner
(2 SWS) (2 cr); Zentralinstitut für Laboratoriumsmedizin und Pathobiochemie, Charité - Campus Benjamin Franklin, Hindenburgdamm 30, Raum 5740 (5. OG, Fahrstuhl 18)
Vorb.: Mi, 16.04., 17.45, Beginn: 30.04., 17.45; Infos unter http://www.charite.de/zlp/lehre/zellbiologie/index.shtml (Querverweis zur Charité CUB 1391) |
(16.4.) |
Hendrik Fuchs,
Otmar Huber,
Jens Dernedde,
Dirk Meyer zum Büschenfelde |
1. Inhalt:
Proteinexpression und posttranslationale Modifikationen; Strukturen und Funktionen des Cytoskeletts; Pro- und Eukaryote Expressionssysteme; Immunfluoreszenzmikroskopie; 2D-Gelelektrophorese; In-vitro-Testsysteme zur Proteasecharakterisierung; PCR und Sequenzierung; Shedding von Zelloberflächenproteinen; Zelladhäsion in dynamischen Systemen und im
Zellverband; die Proteinbiosynthese inhibierende Toxine; Regulation des Eisenstoffwechsels
2. Literatur:
Literaturstudium grundlegender zellbiologischer Prozesse.
PD Dr. H. Fuchs: hendrik.fuchs@charite.de |
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21 630b
- P - |
Zellbiologisches Praktikum für Naturwissenschaftler und Mediziner
(Teilnahme am Zellbiolog. Seminar ist obligatorisch)
(5 SWS) (5 cr); 1.9.-12.9., 8.30-18.30 - Zentralinstitut für Laboratoriumsmedizin und Pathobiochemie, Charité - Campus Benjamin Franklin, Hindenburgdamm 30, Raum 5740 (5. OG, Fahrstuhl 18)
Vorb.: 16.04., 17.45, Infos: Tel.: 8445-2559 oder http://www.charite.de/zlp/lehre/zellbiologie/index.shtml (Querverweis zur Charité CUB 1392) |
(16.4.) |
Hendrik Fuchs,
Jens Dernedde,
Otmar Huber,
José Bernardino González,
Sebastian Riese,
Dirk Meyer zum Büschenfelde,
Jörg Weiske |
1. Inhalt:
In vitro-Testsysteme zur Proteasecharakterisierung; Zelladhäsionsassays; Quantifizierung der
Zell-Zell-Adhäsivität; PCR und Sequenzierung; Immunfluoreszenzmikroskopie; 2D-Gelelektrophorese;
Affinitätschromatographie rekombinanter Proteine. Mechanismus und Wirkung von Toxinen; Cytotoxizitätsassays; in vivo- Mutagenese. Charakterisierung von Sheddingprozessen am Beispiel des humanen Transferrinrezeptors.
2. Literatur:
Literaturstudium grundlegender Methoden in der Zellbiologie und Proteinbiochemie.
PD Dr. H. Fuchs: hendrik.fuchs@charite.de |
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21 631c
- V - |
Postergestaltung und Vortragsrhetorik
; Vorb. und Terminabsprache: 14.04., 16:00 Uhr
MPI für Molekulare Genetik, Ihnestr. 73, im Turm 4, Raum 2.110 |
(14.4.) |
Harald Seitz |
Gemeinsames Erarbeiten von regeln zur Postergestaltung und Vortragsrhetorik, Theorie und Praxis.
Dr. H. Seitz: seitz@molgen.mpg.de |
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21 631d
- S - |
Seminar zur Vorlesung Postergestaltung und Vortragsrhetorik
; Vorb. und Terminabsprache: 14.04., 16:00 Uhr
MPI für Molekulare Genetik, Ihnestr. 73, im Turm 4, Raum 2.110 |
(14.4.) |
Harald Seitz |
Gemeinsames Erarbeiten von regeln zur Postergestaltung und Vortragsrhetorik, Theorie und Praxis.
Dr. H. Seitz: seitz@molgen.mpg.de |
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21 635
- S - |
Medizinische Bioinformatik: Beiträge zur Immunoinformatik
(2 SWS); für Biochemiker (2 cr), für Bioinformatiker (4 cr) Mo 17.00-18.45 - Arnimallee 22, Hs B (Hörsaal)
Institut für Molekularbiologie und Bioinformatik. Bitte Aushang beachten. |
(21.4.) |
Paul Wrede |
Anrechenbar für Bioinformatiker im Schwerpunkt B
E-mail: paul.wrede@charite.de |
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Nachfolgende Veranstaltungen V, S insgesamt 1 SWS/ 1 cr. |
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| Terminänderung |
21 642a
- V - |
Onkogene, Viren und Tumorsuppressorgene und Intervention durch Gentherapie
; Fr 6.6. und Sa 7.6. jeweils 15.15-19.00 - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(6.6.) |
Karin Mölling |
1. Inhalt:
Signaltransduktion in normalen und Tumorzellen, Protein Kinase Kaskaden, Transkriptionsregulation, Proteindomänen, Modulation durch Phosphorylierung, Protein-Protein-Interaktion
Onkogene von Viren und zelluläre Onkogene, Tumorsuppressorgene, Multifaktorielle Krebsentstehung
Viren, molekulare Mechanismen der Replikation, Pathogenese, Schwerpunkt HIV,
Gentherapie (Ribozyme, Antisense, siRNA, Triplex, Immunmodulatoren, Suizidgene, Viren als Vektoren)
2. Literatur:
Molekulare Onkologie, Christoph Wagener, Thieme Verlag (1999)
Molekulare Virologie, S. Modrow u. D. Falke, Spektrumverlag (2003)
Viruses and Human Disease, James H. u. Ellen G. Strauss, Academic Press (2002)
The Biology of Cancer, Robert A. Weinberg, Garland Science (2007)
Retroviruses, J.M. Coffin, S.H. Hughes u. H.E. Varmus, CSHL Press (1997)
Principles of Virology, S.J. Flint et al., ASM Press (2004)
3. Weitere Bemerkungen:
Möglichkeiten zur Labormitarbeit sind in Zürich (Institut für Medizinische Virologie) gegeben (s. 21 642c), (2 Monate nach Absprache)
Prof. Dr. K. Mölling: moelling@immv.uzh.ch |
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21 642b
- S - |
Seminar zur Vorlesung 21642a
; Angaben siehe Vorlesung
Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(s. A.) |
Karin Mölling |
1. Inhalt:
Signaltransduktion in normalen und Tumorzellen, Protein Kinase Kaskaden, Transkriptionsregulation, Proteindomänen, Modulation durch Phosphorylierung, Protein-Protein-Interaktion
Onkogene von Viren und zelluläre Onkogene, Tumorsuppressorgene, Multifaktorielle Krebsentstehung
Viren, molekulare Mechanismen der Replikation, Pathogenese, Schwerpunkt HIV,
Gentherapie (Ribozyme, Antisense, Triplex, Immunmodulatoren, Suizidgene, Viren als Vektoren)
2. Literatur:
Molekulare Onkologie, Christoph Wagener, Thieme Verlag (1999)
Molekulare Virologie, S. Modrow u. D. Falke, Spektrumverlag (2003)
Viruses and Human Disease, James H. u. Ellen G. Strauss, Academic Press (2002)
The Biology of Cancer, Robert A. Weinberg, Garland Science (2007)
Retroviruses, J.M. Coffin, S.H. Hughes u. H.E. Varmus, CSHL Press (1997)
Principles of Virology, S.J. Flint et al., ASM Press (2004)
3. Weitere Bemerkungen:
Möglichkeiten zur Labormitarbeit sind in Zürich (Institut für Medizinische Virologie) gegeben (s. 21 642c), (2 Monate nach Absprache)
Prof. Dr. K. Mölling: moelling@immv.uzh.ch |
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21 642c
- P - |
Mitarbeitspraktikum Signaltransduktion in normalen und Tumorzellen, Viren und Gentherapie
(für Naturwissenschaftler)
; 2 Monate ganztägig, n. V. - Institut für Medizinische Virologie in Zürich
nach Absprache,  00 41-44-6 34 26 52/53, E-Mail: moelling@immv.uzh.ch; Information s. A. |
(n. V.) |
Karin Mölling |
Mitarbeiten max. 8 SWS (ab 6 Wo)
ECTS s. Beschreibung
4 Wochen = 8 cr
6 Wochen = 11 cr
8 Wochen = 13 cr
10 Wochen = 15 cr
12 Wochen = 17 cr
1. Inhalt (contents):
Onkogene, Tumorsuppressorgene, Kinase Kaskaden, Gengregulation, Viren, Gentherapie, Molekulare Mechanismen der Krebsentstehung
2. Literatur (literature):
Ch. Wagner: Molekulare Onkologie, Thieme Verlag, Stuttgart (99)
Modrow/Falke: Molekulare Virologie, Spektrum, Akad. Verlag (2003)
Viruses and Human Disease, James H. u. Ellen G. Strauss, Academic Press (2002)
The Biology of Cancer, Robert A. Weinberg, Garland Science (2007)
Retroviruses, J.M. Coffin, S.H. Hughes u. H.E. Varmus, CSHL Press (1997)
Principles of Virology, S.J. Flint et al., ASM Press (2004)
3 Weitere Bemerkungen (further comments)
auch für Bioinformatiker
4. Beginn (beginning): nach Absprache
Prof. Dr. K. Mölling: moelling@immv.unizh.ch |
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Nachfolgende Veranstaltungen S, P insgesamt 5 SWS/5 cr. |
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21 644a
- S - |
Seminar zum Praktikum "Neurodegenerative Erkrankungen: Aggregation amyloidogener Proteine"
; 2 Wo, tägl., mit P ganztägig - Biochemie Thielallee 63, 006/007 (F-Praktikum)
Platzvergabe: 14.04., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(s. A.) |
Daniela Kaden,
Gerhard Multhaup,
Carina Treiber |
| Prof. Dr. G. Multhaup: multhaup@chemie.fu-berlin.de |
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21 644b
- P - |
Neurodegenerative Erkrankungen: Aggregation amyloidogener Proteine
; 2 Wo, tägl., mit S ganztägig
Biochemie Thielallee 63, 006/007 (F-Praktikum)
Platzvergabe: 14.04., 9.00 - Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(13.10.) |
Daniela Kaden,
Gerhard Multhaup,
Carina Treiber |
| Prof. Dr. G. Multhaup: multhaup@chemie.fu-berlin.de |
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21 646
- S - |
Graduate Students Workshop of PhD and Diploma Thesis Students of Biochemistry
(Englisch); 2 Tage jeweils 10.00-19.00 - s. A. |
(s. A.) |
Petra Knaus,
Gerhard Multhaup,
N. N.,
Lisa-Marie Münter |
| Dr. Lisa Münter: lisamuen@chemie.fu-berlin.de |
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21 648
- S - |
Current literature in Signal transduction of Transforming Growth Factors and Bone Morphogenetic Proteins
(Englisch); Biochemie Thielallee 63, Seminarraum
205, AG Knaus; jeden 1. Do. im Monat, 9.30 - 10.30 Uhr |
(5.6.) |
Petra Knaus,
Gerburg Schwärzer |
Prof. P. Knaus: knaus@chemie.fu-berlin.de
G. Schwärzer: schwarzg@zedat.fu-berlin.de |
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Nachfolgende Veranstaltungen S, P (1 Wo) insgesamt 2,5 SWS/2,5 cr. |
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21 650a
- S - |
Seminar zum Praktikum 21 650b
(Priorität f. Stud. im 6. Fachsemester Biochemie)
; Biochemie Thielallee 63, 006/007 (F-Praktikum)
Platzvergabe: 14.04., 8.30 - Biochemie, Thielallee 63, Seminarraum (Anbau) |
(14.4.) |
Henning Otto |
Im Seminar werden die theoretischen Grundlagen zu den Versuchen des zugehörigen Praktikums erarbeitet. Es werden die Einsatzmöglichkeiten radioaktiver Isotope in den Biowissenschaften, Markierungsmethoden für relevante Moleküle und geeignete Mess- und Nachweismethoden diskutiert. Weiterhin werden nicht-radioaktive Alternativen vorgestellt und mit den entsprechenden radioaktiven Verfahren verglichen.
Weitere Informationen s. 21650b -P-, Praktikum der Radiochemie für Biochemiker, Teil II |
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21 650b
- P - |
Praktikum der Radiochemie für Biochemiker, Teil II
(Priorität f. Stud. im 6. Fachsemester Biochemie)
; 1 Wo. ganztägig - Biochemie Thielallee 63, 006/007 (F-Praktikum)
Platzvergabe: 14.04., 8.30 - Biochemie, Thielallee 63, Seminarraum (Anbau) |
(14.4.) |
Henning Otto |
An ausgewählten biochemischen Experimenten wird der sichere Umgang mit Radioaktivität eingeübt. Zu diesen Experimenten gehören beispielsweise das Erzeugen von Sonden durch die radioaktive Markierung biologischer Makromoleküle (z.B. von DNA-Fragmenten), der Vergleich mit nicht-radioaktiven Markierungsmethoden, der Einsatz solcher Sonden im biochemisch-zellbiologischen Experiment, oder die Untersuchung der Modifikation biologischer Makromoleküle unter Einsatz radioaktiver Isotope (z.B. die post-translationale Modifikation von Proteinen durch Phosphorylierung mit [gamma32P]-ATP).
Die erfolgreiche Teilnahme am Praktikum sowie am begleitenden Seminar 21 650a wird durch das Halten eines Referates zu einem der Seminarthemen und ein Protokoll zu den durchgeführten Experimenten dokumentiert.
Pro Semester werden 3 jeweils einwöchige Durchgänge dieser Veranstaltung mit je 8 Teilnehmern angeboten.
Eingangsvoraussetzung sind das Vordiplom, die erfolgreiche Teilnahme am Praktikum der Radiochemie für Biochemiker, Teil I (21165 -P/S-), sowie das Bestehen eines Eingangstests. |
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Nachfolgende Veranstaltungen S, P insgesamt 5 SWS/5 cr. |
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21 660b
- S - |
Seminar zum Praktikum 21660c
; 2 Wo ganztägig (Termin siehe Praktikum)
Hahn-Meitner-Inst., Glienicker Str. 100, 14109 Berlin, LR. 315, 2. Stock
(Vergabe: 14.4., 9.00 - Thielallee 63, Hs) |
(s. A.) |
Antonios Kyriakopoulos,
Dietrich Behne |
Inhalt:
Das Seminar besteht aus zwei Teilen:
Der erste Teil umfasst die Erläuterungen zu den Aufgaben des Praktikums und darüber hinaus theoretische Grundlagen zu den Suborganellen, in denen die verschiedenen Selenoproteine lokalisiert sind.
Der zweite Teil besteht aus der Diskussion der neuesten Literatur zu den Selenoproteinen. Überdies werden zwei Themen über moderne Proteinbiochemie ausgewählt. Bei den ausgewählten Kapiteln ist der Teamgeist der Studenten gefordert.
Praktikumsaufgaben:
· Isolierung von Selenoproteinen aus verschiedenen Geweben der Ratte
· Subzelluäre Lokalisation von Se-Proteinen (Lysosomen, Golgi-Membranen, Nukleus und Nukleoli)
· Nachweis von 75SeSys mittels RP-HPLC
· DNA/75Se-Protein-Interaktion; Transport von 75Se-Proteinen in den Kernen und Nukleoli von Leber und Niere der Ratte
· Immunochemischer Antigennachweis nach Elektrotransfer
· Densitometrie mit automatischer Auswertung von 1DE und 2DE-Gelen
· Detektion von Selenoproteinen (Audioradiographie)
· Detektion von 75Se (gamma-Spektrometrie)
· Doppelmarkierung von Proteinen mit Radiotracern
Dr. A. Kyriakopoulos: kyriakopoulos@hmi.de |
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21 660c
- P - |
Biochemie von Spurenelementen
; 7.7.-18.7. ganztägig - Hahn-Meitner-Inst., Glienicker Str. 100, 14109 Berlin, LR. 315, 2. Stock
(Vergabe: 14.4., 9.00 . Thielallee 63, Hs) |
(14.4.) |
Antonios Kyriakopoulos,
Dietrich Behne |
Inhalt:
Das Seminar besteht aus zwei Teilen:
Der erste Teil umfasst die Erläuterungen zu den Aufgaben des Praktikums und darüber hinaus theoretische Grundlagen zu den Suborganellen, in denen die verschiedenen Selenoproteine lokalisiert sind.
Der zweite Teil besteht aus der Diskussion der neuesten Literatur zu den Selenoproteinen. Überdies werden zwei Themen über moderne Proteinbiochemie ausgewählt. Bei den ausgewählten Kapiteln ist der Teamgeist der Studenten gefordert.
Praktikumsaufgaben:
· Isolierung von Selenoproteinen aus verschiedenen Geweben der Ratte
· Subzelluäre Lokalisation von Se-Proteinen (Lysosomen, Golgi-Membranen, Nukleus und Nukleoli)
· Nachweis von 75SeSys mittels RP-HPLC
· DNA/75Se-Protein-Interaktion; Transport von 75Se-Proteinen in den Kernen und Nukleoli von Leber und Niere der Ratte
· Immunochemischer Antigennachweis nach Elektrotransfer
· Densitometrie mit automatischer Auswertung von 1DE und 2DE-Gelen
· Detektion von Selenoproteinen (Audioradiographie)
· Detektion von 75Se (gamma-Spektrometrie)
· Doppelmarkierung von Proteinen mit Radiotracern
Dr. A. Kyriakopoulos: kyriakopoulos@hmi.de |
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Nachfolgende Veranstaltungen V/Ü, P insgesamt 2,5 SWS/ 2,5 cr. |
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21 669a
- V - |
Einführung in die Strukturbiochemie
; 5 Tage, parallel zum Praktikum 21669c Block 9.00-11.00 - Forschungszentrum Elektronenmikroskopie Fabeckstr. 36 A, 205
Vorb.: 21.04., 10.00 Uhr s.t. |
(21.4.) |
Christoph Böttcher |
Die Blockveranstaltung wendet sich an Studierende mit Interesse an forschungsrelevanten Fragen der Strukturaufklärung an natürlichen und synthetischen supramolekularen Architekturen und führt insbesondere in elektronenmikroskopische Techniken ein. Fragen der Präparation, insbesondere der Kryofixierung, Grundlagen der Bildgebung und der praktischen Handhabung von Transmissions-Elektronenmikroskopen (TEM) im Kryobetrieb werden theoretisch und praktisch behandelt. Darüber hinaus erfolgt die Einführung in die Prinzipien der digitalen Bildverarbeitung und die Methode der 3D-Rekonstruktion nach der Einzelpartikelmethode.
Dr. C. Böttcher: bottcher@chemie.fu-berlin.de |
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21 669b
- Ü - |
Bildgebende Verfahren und 3D-Rekonstruktionstechniken
; 5 Tage parallel zum Praktikum 21669c Block 11.00-12.00 - Forschungszentrum Elektronenmikroskopie Fabeckstr. 36 A, 205
Vorb.: 21.04., 10.00 Uhr s.t. |
(21.4.) |
Christoph Böttcher |
| Dr. C. Böttcher: bottcher@chemie.fu-berlin.de |
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21 669c
- P - |
Strukturuntersuchungen an natürlichen und synthetischen supramolekularen Architekturen - Einführung in die Elektronenmikroskopie
; Block 2.6.-6.6. 13.00-18.00 - Forschungszentrum Elektronenmikroskopie Fabeckstr. 36 A, 205
Vorbesprechung: 21.04., 10.00 Uhr s.t; Platzvergabe: 14.04., 9.00 Uhr, Biochemie, Thielallee 63, Hs |
(14.4.) |
Christoph Böttcher |
| Dr. C. Böttcher: bottcher@chemie.fu-berlin.de |
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21 671
- V - |
Molekulare Virologie
(2 SWS) (3 cr); Do 16.15-18.00 - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(17.4.) |
Joachim Mankertz,
Annette Mankertz |
Die molekulare Virologie stellt in Abgrenzung zur klassischen Virologie weniger eine Beschreibung der klinischen Aspekte viraler Erkrankungen, sondern vielmehr eine Erläuterung der molekularen Interaktionen besonders zwischen virus- und wirtsspezifischen Proteinen und Nu-kleinsäuren dar. Das Wechselspiel dieser Molekülgruppen ist die Grundlage für den erfolgreichen intrazellulären Parasitismus der Viren. Zunächst wird im Überblick die Geschichte der Virologie von ihren Anfängen im 19. Jahrhundert bis zum Einsatz modernster biochemischer, molekulargenetischer und immunologischer Techniken dargestellt. Nach der Definition des Vi-rusbegriffs erfolgt eine ausführliche Besprechung viraler Strukturen. Funktion und Aufbau des viralen Kapsids, Genomstrukturen, Replikationsmechanismen und die Expression der genetischen Information werden an typspezifischen Beispielen erläutert. Zum Abschluß des allgemeinen Teils werden die Grundlagen virusbedingter Zelltransformation sowie aktuelle Erkenntnisse zur viralen Onkogenese dargestellt. Im speziellen Teil werden Replikationszyklus, Virus-Wirt-Interaktion und Pathomechanismen ausgewählter Virusgruppen besprochen. Den Beginn machen hier die Bakteriophagen, an denen eine Vielzahl bedeutender virologischer Entdeckungen und Techniken zuerst beschrieben wurde. Es folgen Vorlesungen über das humane Immundefizienz Virus, das Hepatitis B Virus, das Epstein-Barr Virus sowie Viren, die Pflanzen infizieren. Den Abschluß der Vorlesungsreihe bildet die Darstellung neuer, unkonventioneller und unklas-sifizierter Viruserkrankungen.
Dr. A. Mankertz: A.Mankertz@rki.de
Dr. J. Mankertz: |
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21 675
- S - |
Anleitung zum wissenschaftlichen Arbeiten
; ganztägig - Deutsches Rheuma-Forschungszentrum, Charitéplatz 1, Berlin-Mitte
(2 84 60-6 55) |
(n. V.) |
Alf Hamann |
| Sekretariat Prof. Dr. A. Hamann: sekretariat_hamann@drfz.de |
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21 676
- S - |
T-Zellclub
(2 SWS) (2 cr); Mo 9.15-11.00 ganzjährig - Deutsches Rheuma-Forschungszentrum, Charitéplatz 1, Berlin-Mitte, Seminarraum 3
(2 84 60-7 00) |
(s. A.) |
Jochen Hühn,
Alf Hamann,
Andreas Radbruch |
| Sekretariat Prof. Dr. A. Hamann: sekretariat_hamann@drfz.de |
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21 677
- S - |
Zellulare und molekulare Immunologie
(Voraussetzung: Vorkenntnisse in Immunologie) (Teilnahme am Seminar ist Voraussetzung für die Teilnahme am Praktikum 21692)
(2 SWS) (2 cr); ab 22.4., jeweils Di 17.30-19.00 - Deutsches Rheuma-Forschungszentrum, Charitéplatz 1, Berlin-Mitte
(telefonische Voranmeldung erbeten: Tel. 28460-654) |
(22.4.) |
Alf Hamann,
Elke O. Luger,
Marc Ehlers,
Jens Geginat |
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21 679
- P - |
Mitarbeitspraktikum für Biochemiker im Hauptstudium
; nach Rücksprache in den Arbeitsgruppen n. V. - Biochemie, Thielallee |
(n. V.) |
Volker Erdmann,
Volker Haucke,
Petra Knaus,
Gerhard Multhaup,
N. N. |
Inhalt:
Ziel des Praktikum ist die Einführung in das eigenständige wissenschaftliche Arbeiten als Vorbereitung zur Diplomarbeit. Die Studierenden arbeiten einzeln unter der persönlichen Betreuung eines erfahrenen Wissenschaftlers an einem aktuellen Forschungsprojekt der Arbeitsgruppe mit. Die/Der Studierende arbeitet entweder Hand in Hand mit dem/der Betreuer/in an dessen/deren Projekt oder erhält ein kleines eigenständiges Subprojekt zur Bearbeitung, das sich in den Rahmen des Forschungsgebietes des/der Betreuer/in einfügt. Das 1:1 Betreuungsverhältnis zwischen Studierenden und Lehrenden und die Bearbeitung von aktuellen Fragestellungen ermöglicht den Studierenden einen guten Einblick in den Forschungsalltag. Während der Zeit des Praktikums nehmen die Praktikanten/innen an den Arbeitsgruppen- und Literaturseminaren der Arbeitsgruppe teil.
Eingangsvoraussetzung ist die bestandene Diplom-Vorprüfung.
Aufgrund der großen Nachfrage ist eine rechtzeitige Anmeldung erforderlich. Hochmotivierte Studierende sind herzlich willkommen und werden bei Anfragen für Diplomarbeiten bevorzugt berücksichtigt.
4 Wochen = 8 cr
6 Wochen =11 cr
8 Wochen = 13 cr
10 Wochen = 15 cr
12 Wochen = 17 cr
E-Mail-Adresse(n):
Prof. V. A. Erdmann: erdmann@chemie.fu-berlin.de
Prof. V. Haucke: vhaucke@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. P. Knaus: knaus@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. G. Multhaup: multhaup@chemie.fu-berlin.de |
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21 680
- C - |
Lise-Meitner-Kolloquium der Biochemie
; laut Aushang Fr 12.00-13.30, ganzjährig - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(s. A.) |
Volker Erdmann,
Volker Haucke,
Petra Knaus,
Gerhard Multhaup |
Prof. Dr. V. A. Erdmann: erdmann@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. V. Haucke: vhaucke@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. P. Knaus: knaus@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. G. Multhaup: multhaup@chemie.fu-berlin.de |
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21 685
- S - |
Doktorand/inn/enseminar "Ausgewählte Gebiete aus der Spurenelementforschung" für Biochemiker, Chemiker, Biologen
(2 SWS) (2 cr); Fr 14.00-15.30 - Hahn-Meitner-Institut, Glienicker Str. 100, 14109 Berlin, Raum LR 338, 2. OG |
(18.4.) |
Antonios Kyriakopoulos,
Dietrich Behne |
Inhalt:
Besprechung von Methoden zur Charakterisierung von ausgewählten Spurenelementproteinen durch Kombination von biochemischen, molekularbiologischen, radiochemischen und elementaranalytischen Verfahren.
Probleme durch Metallkontaminationen bei der Probenvorbereitung und der Anwendung verschiedener Verfahren zur Trennung und Messung von Proteinen.
Detektion von spurenelementhaltigen Proteinen in Suborganellen der Zelle des reproduktiven Systems der Ratte.
Bearbeitung ausgewählter Literatur aus dem Gebiet der Spurenelementproteine und Vorbereitung von kurzen Vorträgen zu diesem Thema.
Dr. A. Kyriakopoulos: kyriakopoulos@hmi.de |
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21 686
- S - |
Kommunikation im Nervensystem
(für Bioinformatiker: 2 cr, anrechenbar im Schwerpunkt A und in Modul 10)
(1 SWS); Vorbesprechung und Terminabsprache am 14.4., 13.00-14.00 - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(14.4.) |
Frank Kirchhoff |
1. Inhalt (Content):
Allgemeine und aktuelle Aspekte der molekularen und zellulären Kommunikationsmechanismen im zentralen und peripheren Nervensystem sollen in Form einer Blockveranstaltung (Symposiumscharakter, zwei volle Tage) diskutiert werden.
General and recent aspects of molecular and cellular communication mechanisms of the nervous system will be discussed at a two-days symposium.
2. Literatur (literature):
Neuroscience-Exploring the Brain (Nov. 2000), 2nd edition by Bear, Connors, Paradiso (ISBN 0683305964)
Literatur (in Englisch) wird zur Verfügung gestellt.
Literature (in English) will be provided to the participants.
Dr. F. Kirchhoff: kirchhoff@em.mpg.de |
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21 688
- V - |
Genexpression und Signaltransduktion
(2 SWS) (3 cr); Do 18.15-20.00 - Biochemie Thielallee 63, Hörsaal |
(17.4.) |
Claus Scheidereit |
Inhalt:
Es werden die molekularbiologischen und biochemischen Aspekte und experimentelle Methoden der Gentranskription und Signaltransduktion in Eukaryonten behandelt. Einzelne Themen: Ebenen der Genexpressions-Kontrolle; Genstrukturen; Polymerasen; Promotor- und Enhancerfunktion; Chromatinstruktur und -Regulation durch Histonazetylierung und -methylierung, Chromatin-Remodellierung; Generelle Transkriptionsfaktoren, Mediator; induzierbare und gewebsspezifische Transkriptionsfaktoren (TFs) (inkl. Steroidrezeptoren, NF-B, AP-1, STAT etc.); DNA Bindungsdomänen; Regulation von TF Kaskaden durch Phosphorylierung, Proteolyse, Ubiquitin-Konjugation, Inhibitoren und Koaktivatoren; Funktion von TFs bei Apoptose (programmierter Zelltod), Proliferation und Onkogenese; Signalwege von der Zellmembran zu TFs; Rezeptor-Tyrosinkinasen und Liganden, Tyrosinkinasen und deren Substrate; IKK, Wnt, TGFß, Notch und Hedgehog Signaltransduktion. De-regulierte Signaltransduktions-Systeme in pathologischen Prozessen; retrovirale Onkogene und Transformation.
Prof. Dr. C. Scheidereit: scheidereit@mdc-berlin.de |
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21 689
- S - |
Immunologie-Seminar
(Vorbereitung und Voraussetzung zum Praktikum Immunologie im WiSe 2008/09)
(1,5 SWS) (1,5 cr); Robert-Koch-Institut, Nordufer 20, 13353 Berlin (U9 Amrumer Str.), Hörsaal
Vorb.:16.4., 17.00 Uhr |
(16.4.) |
Andreas Hutloff,
Brigitte Dorner,
Richard Kroczek |
Inhalt: Einführung in die Grundlagen der Immunologie. Vorstellung und Diskussion ausgewählter aktueller Publikationen.
Prof. Kroczek: KroczekR@rki.de |
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21 690
- W - |
Anleitung zu wissenschaftlichem Arbeiten auf dem Gebiet der Biochemie
(für Diplomand/inn/en und Doktorand/inn/en)
; Mo - Fr ganztägig - Biochemie, Thielallee 63 |
(n. V.) |
Volker Erdmann,
Volker Haucke,
Petra Knaus,
Gerhard Multhaup,
N. N. |
Prof. Dr. V. A. Erdmann: erdmann@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. V. Haucke: vhaucke@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. P. Knaus: knaus@chemie.fu-berlin.de
Prof. Dr. G. Multhaup: multhaup@chemie.fu-berlin.de |
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21 692
- P - |
Zellulare Immunologie
(Voraussetzung: Vorkenntnisse in Immunologie sowie Teilnahme am S 21677)
(5 SWS) (5 cr); 29.9.-11.10., 9.30-18.00 - Deutsches Rheuma-Forschungszentrum, Charitéplatz 1, Berlin-Mitte |
(29.9.) |
Alf Hamann,
Jochen Hühn,
Elke O. Luger,
Alexander Scheffold,
Andreas Thiel |
1. Inhalt (contents):
Funktion und Analyse von Zellen des Immunsystems
2. Literatur (literature):
Janeway: Immunologie
Abbas: Cellular and Molecular Immunology
3. Weitere Bermerkungen:
Voraussetzung ist die Teilnahme am Seminar im SS.
Sekretariat Prof. Dr. A. Hamann: sekretariat_hamann@drfz.de |
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21 695a
- P - |
Charakterisierung pflanzlicher Membranproteine
(5 SWS) (5 cr) (max. 4 Teiln.); Vergabe: 14.04., 9.00 - Biochemie, Hs, Thielallee 63; Block, ganztägig 26.5.-6.6. - Max-Planck-Institut für Molekulare Pflanzenphysiologie Potsdam / Golm, Am Mühlenberg 1, 14476 Golm
Vorb.: 18.04., 8.30, Pflanzenphysiologie, Königin-Luise-Str. 12-16, 012 |
(14.4.) |
Holger Hesse |
Max-Planck-Institut für Molekulare Pflanzenphysiologie Potsdam/Golm, 03 31/5 67 82 47, E-Mail: hesse@mpimp-golm.mpg.de;
Literatur:
-Hesse &Hoefgen (2003) TiPS 8, 259-262
-Hesse et al. (2003) J. Ex Bot. 55, 1283-1292
-Heldt: Pflanzenbiochemie, Spektrum Akademischer Verlag, ISBN 3-8274-0492-4
-Taiz/Zeiger: Plant Physiology, Sinauer Associates, Inc., ISBN 0-87893-831-1 |
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21 695b
- P - |
Mitarbeitspraktikum Biochemie der Pflanze (z.B. Membranproteine)
; ganztägig n. V. - Max-Planck-Institut für Molekulare Pflanzenphysiologie, Am Mühlenberg 1, 14476 Golm, Treffpunkt: Rezeption
nach Absprache, 03 31/5 67 82 47, E-Mail: hesse@mpimp-golm.mpg.de; |
(n. V.) |
Holger Hesse |
Mitarbeit max. 8 SWS (ab 6 Wo.), Eingangsvoraussetzung: bestandene Diplom-Vorprüfung
4 Wochen= 8 cr
6 Wochen= 11 cr
8 Wochen= 13cr
Themen werden individuell abgesprochen, rechtzeitige Anmeldung ist erforderlich.
1. Inhalt:
Molekulare und biochemische Regulation des Schwefelstoffwechsels der Pflanze, HPLC, IC, qRT-PCR,….
2. Literatur:
-Hesse &Hoefgen (2003) TiPS 8, 259-262
-Hesse et al. (2003) J. Ex Bot. 55, 1283-1292
-Heldt: Pflanzenbiochemie, Spektrum Akademischer Verlag, ISBN 3-8274-0492-4
-Taiz/Zeiger: Plant Physiology, Sinauer Associates, Inc., ISBN 0-87893-831-1
PD. Dr. H. Hesse: hesse@mpimp-golm.mpg.de |
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