Die DFG hat sich für einen von der FU vorgeschlagenen Forschungsschwerpunkt "Proteolyse in Prokaryoten" entschieden. Unter der Leitung von Prof. Dr. Regine Hengge-Aronis vom Institut für Biologie am Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie der Freien Universität Berlin werden die molekularen Strukturen und Mechanismen des Proteinabbaus untersucht. Bakterien zeigen eine extreme Fähigkeit, sich an ständig wechselnde Umweltbedingungen anzupassen. Diese Adaptationsfähigkeit beruht auf einer komplexen molekularen Signalverarbeitung und Regulation, die zu starken Veränderungen der Proteinzusammensetzung der bakteriellen Zellen führt. Während bisher fast ausschließlich die Regulation der Synthese von Proteinen erforscht wurde, konzentriert sich der neue Schwerpunkt auf den selektiven Abbau, das heißt: Die kontrollierte Proteolyse von Proteinen als neues Regulationsprinzip.

Besonders wichtig sind hierbei Fragen der hochspezifischen molekularen Erkennung zwischen Proteinen, sowie der Regulation durch extrazelluläre, aus der Umwelt stammende Signale. Die methodischen Ansätze sind weitgehend interdisziplinär und reichen von der Strukturbiologie über genetische, molekularbiologische und biochemische Methoden bis hin zur aktuellen Proteomforschung. Derzeit ist eine Beteilung von achtzehn wissenschaftlichen Gruppen in ganz Deutschland und der Schweiz geplant.